沿革簡史
本系為臺北帝國大學於1928年創校時最早設立的學系之一。前身為理農學部農藝化學科。1945年台灣光復後，本校改制為國立臺灣大學，本系以原日治時代農藝化學科為基礎，合併農學院其他科系部分講座，更名為農學院農業化學系。由於師資陣容堅強，設備完善，旋即於1947年成立研究所碩士班；1956年大學部分兩組：農產製造組與土壤肥料組；1968年更成立博士班，是國立臺灣大學農學院歷史最悠久，體制最完備的科系。
歷任系主任為陳振鐸教授(1947-1971)、陳玉麟教授(1971-1977)、蘇遠志教授(1977-1983)、洪崑煌教授(1983-1989)、楊盛行教授(1989-1992)、宋賢一教授(1992-1995)、王一雄教授(1995-1998)、李敏雄教授(1998-2001) 、李佳音教授(2001-2004)、陳尊賢教授(2004-2007)、李達源教授(2007-2010)、鍾仁賜教授(2010-2013)、黃良得教授(2013-2016)、賴喜美教授(2016-2019)、王尚禮教授(2019-2022)以及現任的許正一教授(2022-2025)。其中更有陳振鐸教授與蘇遠志教授出任生農學院院長 ，陳尊賢教授與李達源教授為副院長。
| 1928~2003 |
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1928年 臺北帝國大學創校
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1928年 理農學部設有農藝化學科
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1945年 國立臺灣大學農學院農業化學系
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| 1947年 成立農化研究所碩士班 |
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1956年 大學部分為農產製造與土壤肥料兩組
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1968年 成立農化研究所博士班；研究所分為土壤肥料、農產製造 、生化營養三組
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1994年 研究所分為土壤環境與植物營養、生物工業化學、生物化學、微生物學、營養科學五組
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2002年 院所改制，更名為生物資源暨農學院，系名仍為農業化學系
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2003年8月起，18位教師移撥至新成立的生命科學院生化科技學系、微生物與生化學研究所; 18位教師留在本院，系名仍為農業化學系。
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